Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC21AQ8NDW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC21AQ8NDW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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