Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms