Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSIP1Q8NA03 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms