Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD53Q8N9V6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD53Q8N9V6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms