Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms