Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms