Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms