Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD4Q8IYR2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms