Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms