Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R42Q7Z4L9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R42Q7Z4L9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms