Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRCQ7RTU9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms