Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms