Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q71RC1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q71RC1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms