Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP12Q6UXS9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms