Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRSAM1Q6UWE0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms