Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD3Q6STE5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms