Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD2Q6P5Q4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms