Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms