Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms