Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms