Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL1Q5VZK9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms