Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms