Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
RSPH4AQ5TD94 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms