Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHSL1Q5SYE7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms