Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms