Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms