Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM1Q2NKQ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms