Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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