Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTC4SQ16873 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms