Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME3Q16798 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME3Q16798 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME3Q16798 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME3Q16798 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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