Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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FOXD1Q16676 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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FOXD1Q16676 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
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FOXD1Q16676 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
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FOXD1Q16676 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD1Q16676 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
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