Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms