Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CARTPTQ16568 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms