Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RYR3Q15413 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RYR3Q15413 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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