Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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