Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
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