Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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NCF4Q15080 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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NCF4Q15080 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCF4Q15080 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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