Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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