Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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