Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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