Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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