Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSHL1Q14406 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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