Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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CKAP5Q14008 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CKAP5Q14008 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CKAP5Q14008 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CKAP5Q14008 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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