Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGRF1Q13972 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGRF1Q13972 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGRF1Q13972 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGRF1Q13972 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGRF1Q13972 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGRF1Q13972 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGRF1Q13972 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms