Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms