Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
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SHROOM2Q13796 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
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SHROOM2Q13796 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
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SHROOM2Q13796 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
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SHROOM2Q13796 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
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