Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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