Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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