Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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