Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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